Оснащен новейшим лабораторным оборудованием для определения пестицидов, токсичных элементов и других испытаний на безопасность продукции сельского хозяйства, перерабатывающей промышленности, средств защиты растений, агрохимикатов и почвы. Испытательный центр оказывает услуги юридическим и физическим лицам по определению соответствия реализуемой продукции действующим санитарным правилам и нормам.

Вместе с районными территориальными отделами и ОРМ обеспечиваем проведение экспертиз, анализов и исследований в области семеноводства, проверяем сортовые и посевные качества семян сельскохозяйственных растений.
Ведем целенаправленную работу по сортообновлению и сортосмене семян перспективными и урожайными сортами сельскохозяйственных культур.

Cпециалисты лаборатории оказывают консультативную, методическую и практическую помощь организациям, юридическим и физическим лицам.
Испытательном центре ФГБУ «Башкирский референтный центр Россельхознадзора» функционирует ПЦР-лаборатория по диагностике инфекционных заболеваний и обнаружению в продуктах генетически — модифицированных источников (ГМИ).

Орган инспекции является функциональным образованием в структуре учреждения ФГБУ «Башкирский референтный центр Россельхознадзора. Создание Органа инспекции закреплено приказом директора Учреждения. Руководителем ОИ является директор ФГБУ «Башкирский референтный центр Россельхознадзора», он осуществляет общее руководство, определяет политику. Техническим директором ОИ является заместитель директора ФГБУ «Башкирский референтный центр Россельхознадзора».